ดินเหนียวจัดว่าเป็นดินที่มีแร่ธาตุอาหารอยู่ในปริมาณเข้มข้น มีความอุดมสมบูรณ์ที่สูง แต่แร่ธาตุบางตัวก็ไม่ออกหลุดออกจากดินเพื่อไปเลี้ยงบำรุงต้นพืชได้ เช่นเดียวกับกรณีของธาตุแมงกานีสนี่ด้วยเช่นกัน ซึ่งหากพืชไม่ได้รับในปริมาณที่พอเหมาะจะส่งผลต่อการออกช่อดอก ขนาดผลและเมล็ด การสุกแก่ของผลผลิต รวมถึงภูมิต้านทานในการต้านโรคและแมลงต่างๆ ด้วย
อาการที่บ่งบอกว่ากำลังขาดธาตุแมงกานีสมีดังนี้• ใบอ่อนมีอาการคล้ายกับธาตุเหล็ก คือ ใบเหลืองซีดในขณะที่เส้นใบยังเขียวปกติ บนใบอาจมีจุดสีน้ำตาลร่วมด้วย หรือใบอาจจะม้วนงอได้• ลำต้นแคระแกรน• ในพวกธัญพืชใบจะเป็นจุดสีเทา• ในจำพวกอ้อยใบจะเป็นขีดโปร่งแสง• ตาข้างแตกกิ่งมากกว่าปกติ• อาจทำให้มีอาการขาดธาตุแคลเซียมที่ใบอ่อนร่วมด้วย